一提到櫻花，一般人普遍認(rèn)為櫻花起源于日本；也有人引用日本《櫻大鑒》中認(rèn)為的日本櫻花是從中國的喜馬拉雅山脈放射狀傳播到日本的說法?，F(xiàn)在普遍被接受的觀點(diǎn)是櫻花起源于中國的西南山區(qū)。
關(guān)于植物起源的問題，在推斷植物起源進(jìn)化歷史時，古植物化石資料是查明其發(fā)源地的重要證據(jù)。根據(jù)化石的記載，第三紀(jì)始新世后期（距今3650萬年前）陸續(xù)有李屬化石發(fā)現(xiàn)。薔薇科植物的花粉在漸新世以后各地均有發(fā)現(xiàn)。在秦嶺以及云南西部都曾發(fā)現(xiàn)李屬植物的化石。始新世中、晚期，在陜西渭南、藍(lán)田，河南南部發(fā)現(xiàn)薔薇、繡線菊、山楂。晚上新世（距今530萬年～180萬年；上新世晚期（杰拉階）（258.8萬年～180.6萬年））云南西部羊邑地區(qū)和龍陵地區(qū)孢粉組合中，均有薔薇科植物的花粉類型，羊邑地區(qū)有山櫻桃等落葉樹種。第四紀(jì)更新世中期（約260萬年～1萬年；中更新世距今100萬～10萬年），日本櫪木縣那須鹽原市發(fā)現(xiàn)該時期的山櫻（Cerasus jamasakura）的葉化石。
薔薇科植物的進(jìn)化順序觀點(diǎn)不一，被更廣泛接受的是繡線菊亞科，薔薇亞科，梨亞科，梅（李）亞科的進(jìn)化順序。櫻屬處于梅（李）亞科比較進(jìn)化的屬，應(yīng)該處于薔薇科進(jìn)化相對比較高級的地位。
櫻屬植物的進(jìn)化演化方向主要為，花序從復(fù)雜趨于簡單，并向單花演化，與之相反，花的直徑有小向大演化?；ㄐ驈目偁罨ㄐ蛳騻惴炕騻阈位ㄐ蜓莼渲虚g有一朵花離生的不規(guī)則傘房或傘形花序?yàn)檫^渡類型，苞片的演化方向是有大型綠色葉狀苞片向小型膜質(zhì)鱗片狀演化，由排列疏松向排列緊密演化。總狀系被認(rèn)為處在櫻屬植物比較原始的類群，腋芽三芽并生的矮生櫻亞屬是該屬最進(jìn)化的類群。
現(xiàn)在我們很難確定櫻花的原始發(fā)生地。經(jīng)研究，北起四川丹巴古稱川滇古陸的地方，自古生代晚泥盆紀(jì)至中生代海侵發(fā)生期間也未被淹沒過，不但植物種類資源豐富，而且其中還有多種帶有原始性狀的種。具備起源地的條件。云南是薔薇科植物的一個現(xiàn)代分布中心和分化中心之一。從櫻屬植物的現(xiàn)代分布格局看，我國的西部、西南部集中分布了櫻屬的主要種類。云南、四川、境內(nèi)或其交接的西藏地區(qū)，普遍存在25個種以上，西南部特有種10種之多，古老的中國西部及西南部高山地區(qū)為本屬的分布中心、原始種保存中心及特有中心。櫻屬植物在中國西南集中分布，同時這些地方還有大量的第三紀(jì)物種孑遺。具備櫻屬的起源地條件，同時，現(xiàn)在利用植物分子親緣地理學(xué)的分析研究表明，該地區(qū)也為起源中心，與現(xiàn)存的櫻屬特有種分布中心、屬的分布中心、原始種保存中心的觀點(diǎn)相符。
從古代地質(zhì)化石考古，原始種、特有種的現(xiàn)代分布情況，植物分子親緣地理學(xué)研究，現(xiàn)在學(xué)者普遍的觀點(diǎn)是中國的云南、四川、西藏交界的山地是櫻屬植物的起源中心。
櫻屬植物在該起源中心發(fā)生后并進(jìn)行了分化，經(jīng)過長期的不斷變遷、演化，向各地?cái)U(kuò)散、遷移、最終形成了現(xiàn)在的分布格局。
